PCI express 2.0 vs 3.0

заметная разница?

в большинстве случаев: нет.

PCI-e v3 может быть в два раза быстрее, чем PCI-e v2, но большинство карт не ограничены пропускной способностью. Для снижения пропускной способности лишь в незначительной (4%-иш) производительности.

есть исключения из этого правила. Е. Г. при использовании GPCPU/технологии OpenCL, где нижняя латентность PCI-Е В3 помогает. Или когда вы используете экстремальные разрешения (скажем, 5760x1920) и высокие настройки в играх. Но в большинстве случаев заметной разницы не будет.

будет ли покупка достойной видеокарты означать не для PCIE 3.0 (GTX 660) быть пустой тратой деньги против покупки другого, который является PCIE 2.0 ?

только если карта с поддержкой v3 дороже, чем карта с равной производительностью, которая использует PCI-e v2, и если вы не собираетесь хранить карту при покупке следующего компьютера.

Отказ от ответственности: все это предполагает, что вы используете слот x16. Если вы кладете карту в слоты x4 или x1, тогда разница в скорости между v2 и v3 становится более выраженной.