Если я правильно понял, eSATA и SATA работают по одному протоколу. Единственные различия: 1) форма порта 2) eSATA обеспечивает питание
Я предпочел бы не использовать корпус, потому что я могу использовать высокоскоростной жесткий диск, но контроллер в корпусе может быть накладные расходы на производительность.