Как использовать autoconf с Cygwin

$ m4 --version

не производить никакой выход является признаком отсутствия dll или несоответствие в их версии из-за неудачного обновления. Бьюсь об заклад, вы обновили cygwin с процессом все еще работает.

running strace m4 --version, вероятно, подтвердит несоответствие версии и сообщит о недостающем символе.

управление зависимостями m4 у нас

$ cygcheck m4
Found: D:\cygwin64\bin\m4.exe
D:\cygwin64\bin\m4.exe
  D:\cygwin64\bin\cygwin1.dll
    C:\windows\system32\KERNEL32.dll
      C:\windows\system32\ntdll.dll
      C:\windows\system32\KERNELBASE.dll
  D:\cygwin64\bin\cygsigsegv-2.dll

конечно, у вас есть cygwin1.dll но это может быть неправильная версия. Для другой зависимости

$ cygcheck -f /usr/bin/cygsigsegv-2.dll
libsigsegv2-2.10-2

Так вы следует переустановить пакеты:cygwin и libsigsegv2