Команда после точки с запятой не выполняется в Crontab?

это может быть растиражирована

sh -c 'pkill -f "MyExecutable.exe" ; touch /tmp/here.log'

Cron выполняет вашу команду, передавая ее в оболочку (sh или другое), настолько эффектно оно очень подобен вышеуказанной линии. Независимо от того, какие MyExecutable.exe работает или нет, pkill -f матчи (также) снаряд и убивает его, прежде чем он работает touch. Это потому что

шаблон обычно сопоставляется только с именем процесса. Когда -f установлено, полная командная строка используемый.

^{(источник: man 1 pkill)}

возможные решения:

1. Если вам не нужен -f, просто брось это:

   42 17 * * 1-5 /bin/pkill 'MyExecutable.exe' ;  touch /tmp/here.log
   

2. Если вам нужен -f, run touch до pkill:

   42 17 * * 1-5 touch /tmp/here.log ; /bin/pkill -f 'MyExecutable.exe'