Можно ли использовать git для синхронизации 2 внешних жестких дисков?

git будет обрабатывать двоичные файлы (хотя и менее эффективно, чем текстовые файлы), поэтому, теоретически, да, вы можете это сделать.

но вы действительно не хотите.

git сохраняет полную историю всех файлов в каждой копии репозитория. Он сжат, поэтому он, вероятно, будет значительно меньше, чем набор активных файлов (если у вас нет длинной и заполненной изменениями истории), но эта история все равно будет потреблять значительный кусок каждого диска. Если вы в частности, вы хотите иметь возможность создавать несколько веток или откатывать изменения на любом диске, это будет много места, потраченного впустую без причины.

лично я использую rsync для такого рода вещей, предполагая, что все копирование будет однонаправленным (т. е. E., "make этой диск выглядит точно так же, как это drive"). Я знаю, что есть и другие инструменты, которые немного более сложные и будут обрабатывать двунаправленные синхронизация (изменения были внесены на обоих дисках с момента последней синхронизации, поэтому объедините наборы изменений), но у меня никогда не было необходимости в этой возможности, поэтому у меня нет рекомендаций.