Откройте два экземпляра Notepad++

кроме открытия другого экземпляра с Alt+F6 (как в ответе @qweet), если у вас уже есть файл, открытый в первом экземпляре Notepad++, вот некоторые альтернативы:

• перейдите на вкладку Файл, а затем перетащите его за пределы окна Notepad++ и поместите его в любом месте за пределами; это откроет новый экземпляр с нужным файлом. Чтобы это работало, первый экземпляр не должен быть развернут, чтобы у вас было пространство для удаления вкладки за пределами окно.
• щелкните правой кнопкой мыши вкладку файла и выберите один из следующих параметров:
  • переехать в новый экземпляр: открывает новое окно с файлом в нем; удаляет файл из исходного экземпляра.
  • открыть в новом экземпляре: открывает новое окно с файлом в нем; сохраняет тот же файл в исходном экземпляре.
  • переместить / клонировать в другое представление: открывает окно разбиения в том же экземпляре, что и файл в окне разбиения.

преимущество всех этих подходов заключается в том, что новый экземпляр уже содержит файл, открытый в исходном экземпляре.

с сайта Мэтта Рефги Как запустить несколько экземпляров Notepad++:

1. щелкните правой кнопкой мыши любой ярлык Notepad++.
2. Выберите Свойства.
3. перейдите на вкладку "Ярлык".
4. в конце поля "объект" добавить "-multiInst".