Хорошая идея разделить мой личный git РЕПО?

если вы хотите разделить репозиторий на несколько новых, вы не сможете использовать filter-branch, Так как это в основном мощный rebase это работает внутри одного репозитория.

вы не можете иметь несколько репозиториев, и по-прежнему хранить историю, так как история состоит из коммитов, которые касаются всех версионных файлов в исходном репозитории. Поэтому я боюсь, что у вас нет другого выбора, кроме как запустить несколько репозиториев с нуля. Конечно, вы можете архивировать оригинал в случае необходимости обращаться к нему.

Я бы определенно избегал создания репозитория Git в любом месте рабочего каталога, т. е. делать git init в каталоге, который уже версирован в Git. Хотя это было бы возможно, это потребует крайней осторожности с --git-dir и/или --work-tree параметры. Вместо этого переместите $HOME/.git каталог в какой-то другой каталог, который не будет версирован перед созданием нескольких репозиториев в разных каталоги.

на .gitconfig файл для каждого пользователя файл конфигурации Git. По умолчанию, он живет в своем $HOME. Так как ваш домашний каталог is ваш рабочий каталог, вы, вероятно, думали, что вам нужен один такой файл в каждом рабочем каталоге, но вы этого не делаете. Файл конфигурации для каждого репозитория .git/config.