Как удалить папку cygwin на диске c?

Если вы получаете сообщение об ошибке, что объект используется, убедитесь, что вы остановили все службы и закрыли все программы Cygwin. Если вы получаете сообщение об ошибке "отказано в разрешении", то вам нужно будет изменить разрешения и / или права собственности на файлы или папки, которые вызывают ошибку. Например, иногда файлы, используемые системными службами, становятся собственностью системной учетной записи и недоступны для записи обычным пользователям.

самый быстрый способ, чтобы удалить все дерево, если вы столкнулись с этой проблемой чтобы сменить владельца всех файлов и папок на ваш счет. Для этого в Проводнике Windows щелкните правой кнопкой мыши корневую папку Cygwin, выберите Свойства, затем вкладку Безопасность. Если вы используете Windows XP Home или простой общий доступ к файлам, вам нужно будет загрузиться в безопасном режиме, чтобы получить доступ к вкладке Безопасность. Выберите дополнительно, а затем перейдите на вкладку владелец и убедитесь, что ваша учетная запись указана как владелец. Выберите флажок заменить владельца подконтейнеров и объектов и нажмите OK. После применения Explorer изменения вы сможете удалить все дерево за одну операцию.

Если вы хотите быть тщательным, вы можете удалить дерево реестра Software\Cygwin в HKEY_LOCAL_MACHINE и/или HKEY_CURRENT_USER. Однако, если вы следовали инструкциям выше, вы уже удалили все важное. Обычно в реестре хранится только каталог установки.

вот источник Cygwin Link